从分析的、还原论思维到整体性思维自近代以来，西方哲学的主流思潮从总体上看是分析性的、还原论的。这种思维方式把自然现象还原为机械运动，进而分解为基本的零部件来认识其构成和功能，它通过设定基元的孤立或独立不变性而忽略了实在的关系特征和整体性。然而这每一步的还原，实际上都是对整体、对过程、对复杂性的一种抽象和切割，致使系统丧失了原有的部分关系和属性。“还原论的思维方式就是把世界分解得尽可能小，尽可能简单。你为一系列或多或少理想化了的问题寻找解题的答案，但却因此而背离了真实的世界，把问题限制到了你能发现解决办法的地步”。由于在基本粒子层次上的可分性将具有全新的意义，部分甚至可能大于或包容整体，因而无论对象是否无限可分，那种机械论意义上的终极基元都是虚幻的。随着 19 世纪自然科学革命的产生，自然科学开始进入整体化发展的时代。量子力学所导致的世界图景是：世界乃是一个不能最终分解为集合的整体。爱因斯坦的广义相对论统一了惯性和引力，并试图把万有引力、电磁力、弱相互作用和强相互作用等四种力统一起来，从而构成一个系统总体性的 “统一场论”，以此来说明在自然界的各种纷繁复杂、千差万别的现象背后的内在统一性和和谐性。的确，我们生活在同一个世界里，而且由来已久，因此，我们必须以一个整体主义的视角去把握这个世界及其各个部分的过去、现在和未来。用整体观点去看世界，要求我们建立起相应的整体方法论。贝塔朗菲的一般系统论认为，系统的性质功能和运动规律只能从整体上方显示出来，因为系统的整体呈现了各个组成要素所没有的新特征，复杂现象大于因果链的孤立属性的简单总和。而耗散结构理论和协同学的发展，则把系统方法对整体的研究进一步动力学化了。这种理论揭示，远离平衡态的系统通过功能耦合的自组织过程，导致了远离热平衡的不可逆结构的相变，会不断自生出新的有序性。当耗散系统与其环境的能量相互作用达到某个临界值时，微观元素的复杂的非线性合作会产生出宏观现象。如电势、光波、流体、云彩、植物、动物、社会或经济力量、情感乃至思想，都可以形成以序参量为标志的宏观现象，他们不可能还原到复杂系统的原子、分子、细胞、集体等微观水平上，而是代表了真实的宏观现象的属性。显而易见，整体性思维方式本质上乃是反还原论的。当然，强调事物的整体性，要求从事物的普遍联系来认识对象，并不排除对事物采取分析的方法。毕竟，仅仅从整体上把握现象和过程而忽视对部分进行认识的整体主义的方式往往是笼统的、模糊的。同时，宇宙全息论认为，部分存在于整体中，而且整体也存在于部分中，因而不认识部分就不能理解整体，不认识整体也就不能理解部分。分形学揭示，自然界的许多复杂的物理现象都具有分形结构，即分形体的整体与部分具有某种自相似性，因而我们在从整体中来认识事物的部分的同时，也可以通过部分来认识事物的整体。此外，由于任何一个系统又是更大系统的一个部分，且不同系统的有机结合方式和特点不同，从而出现了不同质的系统总体形式和多层次性，因此，我们在强调和认识整体性的同时，也不能忽略部分中亦有整体性等。从整体性思维的角度看，不应将组织看作一个分散的互不相关的部分的聚合物，而应看成是一个整体的系统，通过研究整体的性质和结构，进而获取对整体的认识。这就需要全面了解组织和管理行为是如何随时间变化以及导致这些变化的反馈过程，包括对组织不同部分之间的细微的相互作用保持敏感，了解行为的结构和成因以及它们对组织的其他部分的影响等。这种整体性思维在当今管理学的一些领域中实际上已得到不同程度的显现。比如，全面质量管理便充分体现出整体性思维的特征。在全面质量管理的理念中，质量管理不应只是企业中少数质量管理和检验人员的事，而需要企业的所有部门、各类人员，在研制、设计、生产、使用的各个阶段，从上到下都为提高及保证产品的质量而努力。这就必须把技术工作与管理工作紧密结合起来。这里需要一种系统的观念，即组织各类人员都需要有 “全面质量” 的意识而避免本位 “质量” 意识，各环节及部门需要紧密配合，以保证 “全面质量” 的提高等。就组织设计而言，以泰勒、法约尔和韦伯等人为代表的传统组织理论由于过窄集中于组织结构 —— 如劳动分工、工作标准化、规则的表达、书面文件和层级制权威的中央集权等，主要考虑的是任务和职位区别、角色与程序的表达、权威的描述，而严重忽视了与组织结构相联系的系统概念。其后的巴纳德虽然突破了古典学派单纯地把组织视为一个权责结构的框架，将组织定义为 “协作系统”，但他所说的系统是封闭的。事实上，组织系统是开放的，它同周围环境之间存在着动态的相互作用。因而，研究组织的唯一有意义的方法就是把组织看作开放系统来研究。从这种整体论的角度看，组织设计不仅涉及 “硬结构”，而且需要考虑 “软因素”。1988 年，汉宁斯（Hinings）和格林伍德（Greenwood）提出了组织原型（Organization Archetype）的观念，将组织结构理解为是构成一种现行的 “意义范围”“解释框架” 的思想、信念和价值观的化身。按照这一观念，组织的基本结构不是由等级决定的，而是由组织中不同的意识形态的混合方式、对工作本质的不同理解，以及具有不同的意识形态的团体与外部利益相关者之间的关系决定的。从这种意义上讲，文化构成了组织设计最为基本的要素。这包括哈默尔所提出的深层系统设计的观点，如形成学习能力、形成深入思考组织变革问题的人性化过程、形成全方位的沟通渠道、形成恰当的价值观和信仰以支持核心顾客接受的意识形态等。