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主编推荐语

蛋白质组学:研究网络、关键蛋白识别、复合物挖掘、功能预测。

内容简介

蛋白质组学是当前生命科学的新前沿,通过研究蛋白质的功能、结构、相互作用来系统地分析蛋白质,进而分析生命活动,成为热点的研究问题之一。尤其是,从蛋白质网络中进行多物种的关键蛋白识别、蛋白质复合物挖掘、以及蛋白质功能预测,对揭示蛋白质网络的组成结构、预测蛋白质功能、解释特定的生物进程具有重要的研究意义。本书一方面讲述利用蛋白质活性的动态性、蛋白质的亚细胞定位信息,构建精准的蛋白质相互作用网络的方法。另一方面,以此为基础,讲述从新的角度研究生物信息学中与蛋白质相关的几个重要问题,其中包括适用于多物种的关键蛋白识别、蛋白质复合物挖掘、以及蛋白质功能预测。

目录

  • 封面
  • 版权信息
  • 内容简介
  • 前言
  • 第一部分 基础篇
  • 第1章 绪论
  • 1.1 蛋白质相互作用
  • 1.2 蛋白质网络
  • 1.3 关键蛋白质
  • 1.4 蛋白质复合物
  • 1.5 蛋白质功能
  • 1.6 本书的主要内容和组织结构
  • 第二部分 蛋白质网络篇
  • 第2章 蛋白质网络研究现状
  • 2.1 基于蛋白质表达动态性的动态蛋白质网络
  • 2.2 基于多状态下表达及相关性变化的动态蛋白质网络
  • 第3章 动态蛋白质网络的构建方法
  • 3.1 动态蛋白质网络的构建方法
  • 3.2 实验结果及分析
  • 3.3 本章小结
  • 第4章 亚细胞区间蛋白质网络的构建
  • 4.1 亚细胞区间蛋白质网络
  • 4.2 加权蛋白质网络
  • 4.3 本章小结
  • 第三部分 蛋白质复合物识别篇
  • 第5章 蛋白质复合物识别的相关研究
  • 5.1 基于密度和局部搜索的算法
  • 5.2 基于层次聚类的算法
  • 5.3 交叠复合物挖掘的算法
  • 5.4 融合多元数据的蛋白质复合物识别
  • 5.5 动态蛋白质网络中的蛋白质复合物识别
  • 第6章 基于蛋白质复合物形成机制与蛋白质活性的蛋白质复合物提炼方法
  • 6.1 蛋白质复合物的形成机制以及内部活性特征
  • 6.2 蛋白质复合物提炼方法
  • 6.3 实验与分析
  • 6.4 本章小结
  • 第7章 融合蛋白质亚细胞定位信息的蛋白质复合物识别
  • 7.1 密度-扩散中心性
  • 7.2 中心性得分的幂律分布检验
  • 7.3 基于幂律分布的双层聚类算法
  • 7.4 实验与分析
  • 7.5 讨论
  • 7.6 本章小结
  • 第8章 基于k层网络的蛋白质复合物识别研究
  • 8.1 概述
  • 8.2 基于k层网络的蛋白质复合物识别算法
  • 8.3 实验结果及分析
  • 8.4 讨论
  • 8.5 本章小结
  • 第四部分 关键蛋白质识别篇
  • 第9章 关键蛋白质研究现状
  • 9.1 基于拓扑特性的关键蛋白质识别方法
  • 9.2 融合其他生物信息的关键蛋白质识别方法
  • 第10章 基于亚细胞区间蛋白质网络的关键蛋白质识别
  • 10.1 基于亚细胞区间蛋白质网络的关键蛋白质识别方法
  • 10.2 评价指标
  • 10.3 实验结果
  • 10.4 讨论
  • 10.5 本章小结
  • 第11章 基于亚细胞区间重要性的关键蛋白质识别方法
  • 11.1 基于亚细胞区间重要性的中心性方法
  • 11.2 实验结果
  • 11.3 本章小结
  • 第五部分 蛋白质功能预测篇
  • 第12章 蛋白质功能预测研究现状
  • 12.1 蛋白质功能预测的重要性
  • 12.2 预测蛋白质功能的难点
  • 12.3 蛋白质功能预测问题
  • 12.4 蛋白质功能预测研究现状
  • 12.5 蛋白质功能预测的评价方法
  • 第13章 融合蛋白质亚细胞定位信息的蛋白质功能预测
  • 13.1 引言
  • 13.2 蛋白质功能预测方法LSDC
  • 13.3 实验结果
  • 13.4 本章小结
  • 第六部分 展望篇
  • 第14章 蛋白质网络研究的挑战与机遇
  • 14.1 识别可靠的PPI面临的挑战
  • 14.2 特定上下文的动态蛋白质网络的构建
  • 14.3 整合组学中的蛋白质相互作用
  • 参考文献
  • 封底
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出版方

电子工业出版社

电子工业出版社成立于1982年10月,是国务院独资、工信部直属的中央级科技与教育出版社,是专业的信息技术知识集成和服务提供商。经过三十多年的建设与发展,已成为一家以科技和教育出版、期刊、网络、行业支撑服务、数字出版、软件研发、软科学研究、职业培训和教育为核心业务的现代知识服务集团。出版物内容涵盖了电子信息技术的各个分支及工业技术、经济管理、科普与少儿、社科人文等领域,综合出版能力位居全国出版行业前列。