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主编推荐语

以医学数据为例,讲解如何使用R进行数据分析。

内容简介

书中结合大量精选的实例对常用分析方法进行了深入浅出的介绍,以帮助读者解决医学数据分析中的实际问题。

本书共分为14章,第1章~第3章介绍了R语言的基本用法;第4章介绍了数据可视化;第5章介绍了基本的统计分析方法;第6章~第8章介绍了医学研究中最常用的三种回归模型;第9章介绍了生存分析的基本方法;第10章~第12章介绍了几种常用的多元统计分析方法;第13章介绍了临床诊断试验的统计评价指标和计算方法;第14章介绍了在医学科研实践中常用的Meta分析方法。

本书适用于临床医学、公共卫生及其他医学相关专业的本科生和研究生使用,亦可作为其他专业的学生和科研工作者学习数据分析的参考书。阅读本书,读者不仅能掌握使用R及相关包快速解决实际问题的方法,还能更深入地理解数据分析。

目录

  • 版权信息
  • 内容提要
  • 序言
  • 前言
  • 资源与支持
  • 配套资源
  • 提交勘误
  • 与我们联系
  • 关于异步社区和异步图书
  • 第1章 R语言介绍
  • 1.1 什么是R语言
  • 1.2 为什么使用R分析数据
  • 1.3 R的下载与安装
  • 1.4 启动和退出R
  • 1.5 RStudio
  • 1.6 R包
  • 1.6.1 什么是包
  • 1.6.2 包的安装
  • 1.6.3 包的使用和更新
  • 1.7 开始使用R
  • 1.7.1 获取帮助
  • 1.7.2 把R当作一个计算器
  • 1.7.3 R对象
  • 1.8 工作空间管理
  • 1.9 小结
  • 1.10 习题
  • 第2章 创建数据集
  • 2.1 R的数据结构
  • 2.1.1 向量
  • 2.1.2 因子
  • 2.1.3 矩阵
  • 2.1.4 数组
  • 2.1.5 列表
  • 2.1.6 数据框
  • 2.1.7 数据类型的转换
  • 2.2 用R获取数据
  • 2.2.1 获取内置数据集
  • 2.2.2 模拟特定分布的数据
  • 2.2.3 获取其他格式的数据
  • 2.2.4 导出数据
  • 2.2.5 用rio包导入和导出数据
  • 2.3 数据录入
  • 2.4 小结
  • 2.5 习题
  • 第3章 数据框的操作
  • 3.1 用基本包处理数据框
  • 3.1.1 查看数据框里的内容
  • 3.1.2 选取数据框的子集
  • 3.1.3 将数据框按照某个变量的值排序
  • 3.1.4 查找和删除重复数据
  • 3.1.5 在数据框中添加和删除变量
  • 3.1.6 把数据框添加到搜索路径
  • 3.2 用dplyr包处理数据框
  • 3.2.1 使用filter( )和slice( )筛选行
  • 3.2.2 使用arrange( )排列行
  • 3.2.3 使用select( )选择列
  • 3.2.4 使用mutate( )添加新变量
  • 3.2.5 使用summarise( )计算统计量
  • 3.2.6 使用group_by( )拆分数据框
  • 3.2.7 使用传递符“%>%”组合多个操作
  • 3.3 数据框的合并
  • 3.3.1 纵向合并
  • 3.3.2 横向合并
  • 3.3.3 按照某个共有变量合并
  • 3.4 数据框的长宽格式的转换
  • 3.5 缺失值的处理
  • 3.5.1 识别缺失值
  • 3.5.2 探索数据框里的缺失值
  • 3.5.3 填充缺失值
  • 3.6 处理大型数据集的策略
  • 3.6.1 清理工作空间
  • 3.6.2 快速读取.csv文件
  • 3.6.3 模拟一个大型数据集
  • 3.6.4 剔除不需要的变量
  • 3.6.5 选取数据集的一个随机样本
  • 3.7 小结
  • 3.8 习题
  • 第4章 数据可视化
  • 4.1 用R的基础绘图系统作图
  • 4.1.1 函数plot( )
  • 4.1.2 直方图和密度曲线图
  • 4.1.3 条形图
  • 4.1.4 饼图
  • 4.1.5 箱线图和小提琴图
  • 4.1.6 克利夫兰点图
  • 4.1.7 导出图形
  • 4.2 用ggplot2包作图
  • 4.2.1 初识ggplot2包
  • 4.2.2 分布的特征
  • 4.2.3 比例的构成
  • 4.2.4 用函数ggsave( )保存图形
  • 4.3 其他图形
  • 4.3.1 金字塔图
  • 4.3.2 横向堆栈条形图
  • 4.3.3 热图
  • 4.3.4 三维散点图
  • 4.3.5 词云图
  • 4.3.6 动态图形
  • 4.4 小结
  • 4.5 习题
  • 第5章 基本统计分析
  • 5.1 数值型变量的描述性统计分析
  • 5.2 分类变量的列联表和独立性检验
  • 5.2.1 生成频数表和列联表
  • 5.2.2 独立性检验
  • 5.3 连续型变量组间差异的比较
  • 5.3.1 独立样本的t检验
  • 5.3.2 非独立样本的t检验
  • 5.3.3 单因素方差分析
  • 5.3.4 组间差异的非参数检验
  • 5.4 用函数tablestack( )汇总双变量分析结果
  • 5.5 变量间的相关性
  • 5.5.1 连续型变量间的相关性
  • 5.5.2 分类变量间的相关性
  • 5.5.3 相关性的可视化
  • 5.6 小结
  • 5.7 习题
  • 第6章 线性回归分析
  • 6.1 简单线性回归
  • 6.1.1 拟合简单线性回归模型
  • 6.1.2 模型输出结果的解释
  • 6.1.3 回归诊断
  • 6.2 分层线性回归
  • 6.3 多重线性回归
  • 6.3.1 拟合多重线性回归模型
  • 6.3.2 多重共线性
  • 6.3.3 逐步回归
  • 6.3.4 回归诊断
  • 6.4 小结
  • 6.5 习题
  • 第7章 Logistic回归分析
  • 7.1 二分类Logistic回归
  • 7.1.1 Logistic回归模型
  • 7.1.2 Logistic回归实例
  • 7.1.3 表格数据的Logistic回归
  • 7.2 条件Logistic回归
  • 7.3 无序多分类Logistic回归
  • 7.4 有序Logistic回归
  • 7.5 小结
  • 7.6 习题
  • 第8章 Poisson回归分析
  • 8.1 Poisson回归模型
  • 8.2 过度离散的判定及处理
  • 8.3 对数线性模型
  • 8.4 小结
  • 8.5 习题
  • 第9章 生存分析
  • 9.1 生存对象
  • 9.2 生存率的估计与生存曲线
  • 9.3 生存率的比较
  • 9.4 Cox回归
  • 9.4.1 建立Cox回归模型
  • 9.4.2 比例风险假定的检验
  • 9.4.3 生存的预测
  • 9.5 小结
  • 9.6 习题
  • 第10章 聚类分析
  • 10.1 相似性的度量
  • 10.1.1 样品间的距离
  • 10.1.2 变量间的相似系数
  • 10.2 层次聚类法
  • 10.2.1 类之间相似系数的定义
  • 10.2.2 Q型聚类
  • 10.2.3 R型聚类
  • 10.3 k均值聚类法
  • 10.4 小结
  • 10.5 习题
  • 第11章 判别分析
  • 11.1 距离判别
  • 11.2 K最邻近判别
  • 11.3 Fisher判别
  • 11.4 Bayes判别
  • 11.5 小结
  • 11.6 习题
  • 第12章 主成分分析和因子分析
  • 12.1 主成分分析
  • 12.1.1 主成分的定义
  • 12.1.2 主成分的求解
  • 12.1.3 主成分分析的注意事项
  • 12.2 因子分析
  • 12.2.1 因子分析模型的定义
  • 12.2.2 因子分析模型的求解
  • 12.2.3 因子旋转
  • 12.2.4 因子分析的注意事项
  • 12.3 小结
  • 12.4 习题
  • 第13章 临床诊断试验评价
  • 13.1 二分类结果的评价指标
  • 13.1.1 灵敏度和特异度
  • 13.1.2 预测值
  • 13.1.3 图解灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值
  • 13.1.4 诊断试验的综合评价指标
  • 13.2 ROC及曲线下面积
  • 13.2.1 单个ROC分析
  • 13.2.2 两个ROC的比较
  • 13.2.3 Logistic回归的ROC曲线
  • 13.3 联合试验
  • 13.4 小结
  • 13.5 习题
  • 第14章 Meta分析
  • 14.1 Meta分析的基本步骤
  • 14.2 Meta分析的常用统计方法
  • 14.3 二分类变量资料的Meta分析
  • 14.3.1 OR、RR或RD的合并
  • 14.3.2 发表偏倚的识别
  • 14.3.3 敏感性分析
  • 14.4 连续型变量资料的Meta分析
  • 14.5 Meta分析的注意事项
  • 14.6 小结
  • 14.7 习题
  • 习题参考答案
  • 第1章 习题参考答案
  • 第2章 习题参考答案
  • 第3章 习题参考答案
  • 第4章 习题参考答案
  • 第5章 习题参考答案
  • 第6章 习题参考答案
  • 第7章 习题参考答案
  • 第8章 习题参考答案
  • 第9章 习题参考答案
  • 第10章 习题参考答案
  • 第11章 习题参考答案
  • 第12章 习题参考答案
  • 第13章 习题参考答案
  • 第14章 习题参考答案
  • 参考文献
  • 函数索引
  • 版权声明
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出版方

人民邮电出版社

人民邮电出版社是工业和信息化部主管的大型专业出版社,成立于1953年10月1日。人民邮电出版社坚持“立足信息产业、面向现代社会、传播科学知识、服务科教兴国”,致力于通信、计算机、电子技术、教材、少儿、经管、摄影、集邮、旅游、心理学等领域的专业图书出版。